A sorozat második évadjában folytatódnak és fokozódnak az Oceanic Flight 815-ös repülőgép katasztrófáját túlélő utasok megpróbáltatásai. Már tudják, hogy nincsenek egyedül a szigeten, de nem sejtik, hogy milyen szándékok vezérlik a többieket. A korábban talált csapóajtó felnyitásától azt remélték, hogy választ kaphatnak kérdéseikre és megoldódik az egyre nyomasztóbb rejtély, de a mélyben csak újabb, a korábbiaknál ha lehet még rémisztőbb kérdések várják a túlélőket. Lehet, hogy a csapóajtóval Pandora szelencéjét nyitották ki? A sorsszerűen visszatérő számsorozat (4, 8, 15, 16, 23, 42) pedig újra és újra felbukkan…