1972. augusztus 15-én született a Kaliforniában lévő Berkeley-ben, később elköltözött Massachusettsbe. 8 évesen játszott az Amerikai Közszolgálati Televízió egyik sorozatában (The Voyage of the Mimi). Utána nem kapott nagyobb szerepeket, de az 1992-ben készült School Ties-ban újra feltűnt. Affleck ebben a filmben szerepelt először együtt ma már elválaszthatatlan barátjával és kollégájával, Matt Damonnal.

Az elismerést a Good Will Hunting hozta meg számukra. A film forgatókönyvét ők írták, amit 600 ezer dollárért eladtak a Miramax főnökének, Harvey Weinsteinnek. Affleck és Damon ebben a filmben korukat meghazudtolóan dolgozták ki a történetet és a karaktereket. A nézőktől és a szakmától egyaránt elismerést kaptak. Damon és Affleck összesen 8 díjat kapott forgatókönyvükért (köztük a Golden Globe-ot és az Oscart).

Affleck Gwyneth Paltrow-val volt együtt egészen 1999 januárjáig. Szeret motorozni, öt motorja is van. Három-négy filmet forgat évente, saját produceri céget vezet Matt Damonnal. 2001-ben a nagy sikerű Pearl Harbor – Égi háború-nak volt a főszereplője, 2002-ben pedig az Ütközéspont és A rettegés arénája című filmjét mutatták be a mozik. 2003-ban a Fenegyerek című filmben tért vissza.

2005 júliusában feleségül vette filmbeli partnernőjét, Jennifer Garner-t, aki decemberben egészséges kislánnyal ajándékozta meg. Második kislányuk, Seraphina 2009. január 9-én született.
A 2006-os Velencei Filmfesztiválon Affleck elnyerte a legjobb színésznek járó Volpi Cup díjat George Reeves tévés Superman-színész megformálásáért a Hollywoodland című filmben.

Testvére Casey Affleck, szintén színész. A magyar nevet szülei egyik szomszédjuk tiszteletére adták Bennek.

2010-ben láthatjuk a Tolvajok városa című filmben, melynek a rendezője, és még a forgatókönyv írásba is belesegített. A filmben láthatjuk még Rebecca Hallt-, John Hamm-et,  Jeremy Rennert illetve Blake Lively-t is.

2012-ben pedig az Untitled Terrence Malick Project című romantikus drámájában lesz főszereplő. Partnere Rachel McAdams, Rachel Weisz, Javier Bardem és Olga Kurylenko.